PRIMACEN

Dernières nouvelles

Guide des bonnes pratiques pour la gestion des données de la recherche en BioImagerie

Le groupe de travail GeDem du réseau technologique RTmfm (réseau rattaché à la MITI du CNRS) a rédigé un Guide des bonnes pratiques pour la gestion des données de la recherche en BioImagerie - accessible ici.

En prenant pour cas d'usage la microscopie photonique, ce guide décrit les notions fondamentales et les bonnes pratiques de la gestion FAIR de données d'imagerie, de la planification à la diffusion en assurant leur accessibilité, leur pérennité et leur réutilisation dans une démarche FAIR.

L'objectif de ce guide est d'offrir aux ingénieurs et aux chercheurs un accompagnement dans la gestion des données.

Alexis Lebon

Workshop PRIMACEN - NIKON

Magalie Bénard

Organisée en deux pôles, PRIMACEN propose un continuum dans le domaine de l'imagerie cellulaire depuis la synthèse de biomarqueurs et la préparation des échantillons jusqu'à la localisation et la détermination de l'activité biologique d'une molécule d'intérêt. PRIMACEN est intégrée à l'US 51 HeRacLeS

Les Responsables de PRIMACEN

Responsable Scientifique

Dr Ludovic GALAS

Responsables Techniques


Dr Magalie BÉNARD	Dr Sophie BERNARD	Dr Jérôme LEPRINCE

Nos Pôles

PÔLE IMAGERIE CELLULAIRE

La stratégie du pôle "Imagerie cellulaire" repose sur 3 piliers avec i) la préparation des échantillons (procaryotes, eucaryotes d’origine végétale et animale), ii) les acquisitions d’images en microscopie photonique et électronique et iii) le traitement et l’analyse d’images (solutions "open source" et commerciales incluant celles d’intelligence artificielle). En particulier, le pôle imagerie cellulaire propose une approche multi-échelle avec des équipements de macroscopie (champ large et confocale), de mésoscopie (feuille de lumière), de microscopie photonique (champ large, à ondes évanescentes, confocale, FLIM, biphotonique), de nanoscopie (STED), de microscopie électronique en transmission et de microscopie corrélative (CLEM en mode température ambiante et en mode cryo) afin de couvrir un large spectre de résolutions spatiales, temporelles, spectrales et de durée de vie de fluorescence.

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PÔLE PHARMACO-CHIMIE DES PEPTIDES

Les études menées à partir des équipements du Pôle pharmaco-chimie des peptides consistent d’une part à concevoir, synthétiser, purifier, analyser et caractériser des peptides, analogues peptidiques ou biomarqueurs et d’autre part à identifier et déterminer la fonctionnalité de molécules naturelles ou de synthèse. La principale question abordée porte sur l'étude des relations structure-activité de peptides biologiquement actifs, mais le domaine d'activité du service couvre aussi la fourniture de peptides et analogues d'intérêt à l'exclusion des protocoles d'administration chez l'Homme. Les tests fonctionnels sont effectués sur des cultures de lignées cellulaires et des cultures primaires par des techniques de spectrofluorimétrie. Les tests biologiques proposés sont par exemple la mesure de variations de la [Ca2+]i, d'AMPc, de potentiel membranaire, d'activités enzymatiques ou encore de survie cellulaire. Ils sont réalisés par des approches à faible et moyen débit, soit au niveau d'une cellule unique soit au niveau d'une population cellulaire, en fonction du nombre d'échantillons à analyser et du type de problème à résoudre.

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Partenaires

Projet cofinancé par l’Union Européenne et la Région Normandie. L’Europe s’engage en Normandie avec le Fonds Européen de Développement Régional (FEDER).

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